澳門政府對非凡航空的「不負責任」予以嚴詞斥責，不留情面地指以紅色資本家顏延齡為主席的非凡航空出事後「極不合作」，形容對方「沒有誠意解決問題」，但當局未有提及具體解決措施。澳門學者形容事件是上任短短3個多月的特首崔世安面對的第二大危機，認為崔世安政府出手愈快、態度愈強硬，才有助他建立管治威信。

澳門民航局長陳穎雄說，澳門政府一直盡最大努力期望非凡航空合作解決問題，但他指斥非凡在過程中極不合作，「甚至在政府協助受影響乘客時，也不提供必要的資料，包括乘客名單，導致疏導工作進度緩慢」，他形容對方沒有誠意解決問題，又指非凡不履行商業責任，多次損害公眾利益。

澳門問題專家譚志強指出，當年澳門政府不理社會各界反對，借錢給私人經營的非凡航空已引起極大爭議，更埋下今天的伏線。他形容組成不久的崔世安政府已「連衰兩鑊」，繼早前上門搜查澳亞衛視惹來非議後，今次是對澳門政府威信的第二大打擊。他指出，崔世安政府將問題「處理得愈強硬愈快愈好」，能揪出當年有份批貸款的人更好，「這樣才有助他建立威信」。

澳門立法會議員區錦新批評澳門政府一直漠視非凡航空長久的業務問題，又指澳門危機辦欠缺具體計劃協助滯留旅客。

非凡航空主席顏延齡是澳門及內地著名商人和慈善家、澳門中華媽祖基金會董事局主席，同時是全國政協的經濟委員會副主任；年前去世的澳門前特首何厚鏵胞兄何厚炤亦曾是非凡航空的股東。

非凡航空2008年一度面臨財困，由澳門政府貸款借錢2億紓困，公司執行董事何敬麟去年初接受訪問時曾笑言﹕「也許今年年尾，我也是300多名（當時非凡航空員工人數）失業者之一。」